Kurs: Metody klasteryzacji hierarchicznej w biologii
Joanna Całkiewicz | 2009-05-04
Odział Gdański Polskiego Towarzystwa Genetycznego, przy współpracy Sopockiego Towarzystwa Naukowego i Instytutu Oceanologii PAN, zaprasza na trzydniowy kurs pod tytułem: Metody klasteryzacji hierarchicznej w biologii w dniach 18-20 czerwca 2009.
Celem kursu jest przybliżenie uczestnikom metod klasteryzacji danych biologicznych. Warsztaty obejmują zarówno wykłady jak i zastosowanie omawianych metod. Znaczna część ćwiczeń będzie wykonywana w pakiecie R (Freeware).
Plan zajęć:
18 czerwca – prowadzący dr hab. Borys Wróbel (Instytut Oceanologii PAN, Sopot)
Wstęp do pakietu statystycznego R.
19 czerwca – prowadzący dr Przemysław Biecek (Instytut Matematyki Stosowanej i Mechaniki, UW)
Wprowadzenie do analizy skupień oraz do hierarchicznej analizy skupień. Prosty przykład wyznaczania dendrogramu (metoda przez łączenie).
Różne metody wyznaczania odległości pomiędzy obiektami oraz różne kryteria łączenia grup.
Inne algorytmy grupowania, grupowanie przez podział, algorytmy grupowania dużych zbiorów danych i grupowanie rozmyte (metody: diana, clara, mona).
20 czerwca – prowadzący dr Przemysław Biecek (Instytut Matematyki Stosowanej i Mechaniki, UW)
Bootstrapowe metody oceny stabilności grupowania (pakiet pvclust).
Techniki skalowania wielowymiarowego i ich związek z analizą skupień.
Inne zagadnienia związane z analiza skupień (likelihood linkage analysis z pakietu LLAhclust, wyszukiwanie skupien z pakietu dynamicTreeCut, klastrowanie hybrydowe z pakietu hybridHclust).
Cena kursu: 500 zł
Opłata obejmuje: koszty zajęć praktycznych i wykładów, materiały szkoleniowe i koszty organizacyjne, przerwy kawowe
Miejsce: Instytut Oceanologii PAN, ul. Powstańców Warszawy 55, Sopot
Data przyjmowania zgłoszeń: 31 maj 2009
Więcej informacji: kurs.sopot@gmail.com lub tel.: +058 7311764
Opłatę należy wpłacić na konto:
Zarząd Główny Polskiego Towarzystwa Genetycznego
Instytut Biochemii i Biofizyki PAN
02-106 Warszawa, ul. Pawińskiego 5a
Bank Millenium, Warszawa
66-11602202-0000000029252294
Prosimy o poinformowanie organizatorów o dokonaniu wpłaty.
---
Serwis BioTechnolog.pl sprawuje patronat medialny nad kursem: Metody klasteryzacji hierarchicznej w biologii.